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先进基因组医学云基础设施

通过 塔潘Mehta
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计算技术、数据存储和基因排序综合能力将决定个性化医学的未来

快速排序和解析基因组信息能力快速成为改善人体健康的基本驱动力完成首选人类基因组序列2003年科学家耗时13年,国际努力和数十亿美元投资当前测序实验室数日内可排出数以百计全序单个人类基因组,成本低至299元.雄心勃勃的努力如100,000基因组项目,全美NIH研究项目(100万基因组)以及其他国家和国际努力研究产生宝贵的信息轨迹,供科学家探索并深入查询和理解开发基础、疾病和其他各种特征基因组学领域这种快速持续创新正在驱动越来越多的药房和学术中心接受云基以获取弹性高成本效益资源

生成序列即为启动

这一领域大部分加速都涉及新排序技术,如Illuma技术、OxfordNanopore技术公司和PacBio公司开发技术提高基础调用精度,增长读数并增速同时降低成本

输出端破译基因组序列可占用数据库150GB/基因组.可说真的,这只是开始映射读取并基于序列集合高层次推理需要强健快速缩放计算电量、数据存储、传输、检索和分析资源,数数数随着百万兆位项目飞速增长量子显示基因和同型关系的最大前景多语类分类可分解成特定人群,提供最精确相关和预测单人类基因组序列估计会占用到40字节数据2025年时 人序比为1:1很容易看出这个数会剧增 并加转录器 后发机 单细胞 时间调控层

从最近全球科学界理解并征服COVID-19的努力中可以明显看出这些工具的价值病毒序列发布后不到一个月 疾病获得国际识别疫苗开发并批准, 一些可以支持超相容基础设施HCI和云层.但仍有很多问题有待理解,例如为什么某些个人易感性而其他人无阻性,排序努力在回答这些问题方面大有希望。持续排序还快速识别可能影响毒理和疾病严重程度的新变异,为更好的公共卫生决策提供信息并帮助疫苗开发者先变

图片来源:NHS

右数据基础设施

数据处理必须拥有贵宾座, 努塔尼斯云软件和HCI解决方案完全适合处理数据丰富环境变化需求Nutanix软件可简化硬件存取和控制程序,通过单接口存储处理数据,无论数据在预存状态,公共云或私有云中,或从更常见的角度看,在单接口处理数据混合云环境Nutanix简化技术以便集中关注数据,我们使用软件定义HCI实现简化允许工具同时或混合云环境运行, 并使用Web标度架构构建-为Google、Amazon和脸书技术工作规模制作很容易看到这是支持大规模排序项目所需的框架有了Nutanix解决方案,存储和管理完全分布于各种节点,以防止单点故障,创建冗余帮助保证数据完整性,为联想基因组分析铺路GA4GH支持并允许数据保留本地存储并遵守与数据分享有关的司法约束

多项目规模小效率提高可与大节省相提并论数据传输和处理的每一元素都延迟处理,可通过优化数据处理处理解决延时问题。Stacey Gabriel,广学学院基因组平台高级主管,最近讲解Nutanix软件帮助自动识别处理和传输数据以优化工作流程中的这些瓶颈此外,通过整合云解法,计算和存储需求可快速增减,处理顺序项目的具体需求,实现支出效率最大化优化访问基本无限资源最理想地利用先进解析力、机器学习力和人工智能力和人口规模研究必备元素

数据密集性基因组测序并扩展未来视线,拥有正确基础设施处理这些数据需求至关重要。数据需求似乎只准备近距离增长,这些技术肯定会参与设计未来药物干预并带来额外不可预见收益学习更多Nutanix帮助组织的方法www.Nutanix.com/Testdrive.测试驱动器使你体验公共云的简单敏捷性,并伴之以性能、安全性能和控制私云

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